Isso é feito pelo próprio assinante, no menu CADASTRO > MINHAS EMPRESAS. É só clicar no nome da empresa e depois no botão AÇÕES e depois em alterar logo.

Você poderá colocar 3 tipos distintos de logotipos:

1. para aparecer dentro do sistema, no lado superior esquerdo da tela em formato JPG, GIF ou PNG de 160x60. Caso não queira que tenha uma caixa branca de fundo deve ser feito em PNG transparente.
2. para constar no lado esquerdo do cabeçalho nos PDFs, sendo que este NECESSARIAMENTE deve ser em JPG. Tamanho 200x80.
3. para colocar um logo que utilizará todo o espaço do cabeçalho do PDF, não exibindo assim as informações cadastradas no Minhas Empresas. Formato: jpg ou png. Tamanho: 1370x160.

Como mostra nesta imagem: